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자료유형
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저자정보
지은이 (한국생명공학연구원) 안명숙 (한국생명공학연구원) 이영표 (팜한농) 성순기 (팜한농) 민병환 (경북대학교) 유장렬 (한국생명공학연구원) 김석원 (한국생명공학연구원)
저널정보
한국식물생명공학회 Plant Biotechnology Reports Plant Biotechnology Reports 제12권 제3호
발행연도
2018.6
수록면
217 - 228 (12page)

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The purpose of this study is to establish the rapid discrimination system of cybrid callus lines by Fourier transform infrared (FT-IR) spectroscopy without genetic fingerprinting analysis. Genomic DNA isolated from two parental lines (Brassica oleracea var. capitata and Raphanus sativus L.) and their cybrid callus lines were analyzed by FT-IR spectroscopy in the spectral region from 4000 to 400 cm?1. Several spectral differences between the two parental lines were detected in the frequency regions of N?H stretching (amide I), C=O stretching vibrations (amide II), and PO2 ? ionized asymmetric and symmetric stretching. Principal component analysis (PCA) and partial least squares discriminant analysis (PLS-DA) were used to discriminate cybrid cell lines from the two parental species at the genomic DNA level. PLS-DA analysis provided more clear discrimination between the two parental lines and their progeny cybrid lines in the score plot. PCA loading values also showed that obvious spectral differences played a significant role in discrimination between the two parental lines and their cybrid lines. These spectral differences might be directly related to subtle changes in the base functional groups and backbone structures of genomic DNA. Considering these results, this technique could provide a research foundation for the FT-IR spectral-based diagnosis, selection, and discrimination of parental lines and their cybrids. Furthermore, this technique could be applied in the hybrid seed industry for rapid screening with high heterogeneity.
#Genomic DNA #Parental lines #Cybrid #FT-IR #PCA #PLS-DA

목차

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Akagi H / 1995 / Genetic diagnosis of cytoplasmic male sterile cybrid plants of rice / Theor Appl Genet 90(7-8):948~951 google schola Akagi H / 1995 / Stable inheritance and expression of the CMS traits introduced by asymmetric protoplast fusion / Theor Appl Genet 91(4):563~567 google schola Banyay M / 2003 / A library of IR bands of nucleic acids in solution / Biophys Chem 104:477~488 Crossref Brewer SH / 2002 / Detection of DNA hybridization on gold surfaces by polarization modulation infrared reflection absorption spectroscopy / Langmuir 18:4460~4464 Crossref Dovbeshko GI / 2000 / FTIR spectroscopy studies of nucleic acid damage / Talanta 53:233~246 Crossref

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