3D-QSAR Analyses on the Inhibitory Activity of [(2-Phenylindol-3-yl)-methylene]propanedinitrile Analogues against Breast Cancer Cell and the Ligand Design of Active Molecules

Soung, Min-Gyu; Myung, Pyung-Keun; Sung, Nack-Do

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자료유형: 학술저널

저자정보: Soung, Min-Gyu (Division of Applied Biology & Chemistry, Chungnam National University) Myung, Pyung-Keun (College of Pharmacy, Chungnam National University) Sung, Nack-Do (Division of Applied Biology & Chemistry, Chungnam National University)

저널정보: 한국응용생명화학회 Applied Biological Chemistry Applied Biological Chemistry 제52권 제1호

발행연도: 2009.1

수록면: 28 - 33 (6page)

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Three-dimensional quantitative structure-activity relationships (3D-QSARs) on the inhibitory activity of [(2-phenylindol-3-yl)methylene]propanedinitrile analogues ($1{\sim}19$) against human breast cancer cells (MDA-MB 231) were studied using comparative molecular field analysis (CoMFA) and comparative molecular similarity indices analysis (CoMSIA) methods. The optimized CoMFA model 2 (${r^2}_{cv.}(q^2)$=0.581, ${r^2}_{ncv.}$=0.970) model predictability was lower than that of CoMSIA model 2, but showed better fitness than the CoMSIA model 2 (${r^2}_{cv.}(q^2)$=0.970, ${r^2}_{ncv.}$=0.886). The contour maps showed that, the inhibitory activities of the analogues against breast cancer cells were expected to increase when hydrophilic and steric favor groups with less than five carbon atoms were substituted at the $R_1$ position. However, it was predicted that the negative charge $R_2$ favor group and hydrophobic favor, along with the positive charge favor and steric $R_3$ disfavor group will achieve the inhibitory activity. The inhibitory activity ($IC_{50}$=0.0018 ppm) against breast cancer cells of the newly designed molecule (P1) with optimized CoMFA model 2 was 20-fold higher than that of the commercialized drug, Docetaxel ($IC_{50}$=0.04 ppm).

#breast cancer cells #MDA-MB 231) #CoMFA #CoMSIA #3D-QSAR #ligand design #[ #2-phenylindol-3-yl)methylene]propanedinitrile analogues

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성민규

소속기관 Division of Applied Biology & Chemistry, Chungnam National University

주요연구분야 농수해양학 > 농학

논문수 8 이용수 2

Myung, Pyung-Keun

소속기관 Department of Pharmacology, Chungnam National University

주요연구분야 농수해양학 > 농학

논문수 5 이용수 0

Sung, Nack-Do

소속기관 충남대학교 농업생명과학대학 응용생물화학과

주요연구분야 농수해양학 > 농학 의약학 > 약학

논문수 63 이용수 139

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