Detection of Whole-Genome Resequencing-Based QTLs Associated Pre-Harvest Sprouting in Rice (Oryza sativa L.)

장성규

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자료유형: 학술저널

저자정보: 장성규 (Department of Plant Bioscience College of Natural Resources and Life Science Pusan National Univ.)

저널정보: 한국육종학회 Plant Breeding and Biotechnology Plant Breeding and Biotechnology Vol.8 No.4

발행연도: 2020.1

수록면: 396 - 404 (9page)

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Pre-harvest sprouting (PHS) is one of the important traits that not only cause serious economic issues but also lead toreduction in grain quality and yield in rice (Oryza sativa L.). To analyze the quantitative trait loci (QTLs) for PHS tolerance, weevaluated PHS, seed dormancy (SD), and low-temperature germination (LTG) of 88 F2:3 populations and their parental lines. Genotypicanalysis was performed by using 441 single nucleotide polymorphisms (SNPs) detected from re-sequencing data. Seed dormancy (SD)and low-temperature germination (LTG) were identified to exhibit a positive correlation with PHS. Under the field condition, two majorQTLs for PHS, qPHS1-1FCand qPHS1-2FCwere identified on chromosome 1. Under the growth chamber condition, qPHS1-1GCandqPHS1-2GChad the same regions on chromosome 1. QTLs of SD and LTG (qSD1-1, qSD1-2, qLTG1-1, and qLTG1-2) had the sameregions; these results suggested that candidate QTLs demonstrate pleiotropy about PHS, SD, and LTG. The major QTLs detected in thisstudy are hypothesized to provide an important resource for molecular breeding and gain a better understanding of the genetics of traitsin rice.

#Pre-harvest sprouting #Whole genome resequencing #Recombinant inbred lines #Rice #QTL

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Almansouri M / 2001 / Effect of salt and osmotic stresses on germination in durum wheat(Triticumdurum Desf.) / Plant Soil 231:243~254

Bewley JD / 2013 / Seeds: physiology of development, germination anddormancy / Springer

Cai HW / 2000 / Genomic regions affecting seed shattering and seed dormancy in rice / Theor. Appl. Genet 100:840~846

Chen CX / 2008 / A major QTL controlling seed dormancy and pre-harvest sprouting resistance on chromosome 4A in a Chinese wheat landrace / Mol. Breed 21:351~358

Cheon KS / 2020 / QTL mapping for pre-harvest sprouting resistancein japonica rice varieties utilizing genome resequencing / Mol. Genet. Genom 295:1129~1140

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