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학술저널
저자정보
신재훈 (한림대학교) 이경미 (한국과학기술연구원) 신지민 (한국과학기술연구원) 강규동 (가톨릭대학교) 노주원 (한국과학기술연구원) 조윤신 (한림대학교)
저널정보
한국유전학회 Genes & Genomics Genes & Genomics Vol.41 No.5
발행연도
2019.1
수록면
537 - 545 (9page)

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Background Type 2 diabetes (T2D) is known as an inflammatory disease. NRF2 (Nuclear Factor Erythroid 2 Like2) encodes a transcription factor that binds to antioxidant response elements (AREs) and regulates the expression of genes involved in many antioxidant responses. Objective This study aimed to gain insight into individual anti-inflammatory activity to prevent T2D development in humans. Methods We performed a genome-wide association study (GWAS) to identify genetic variants influencing NRF2 expression in LCLs (lymphoblastoid cell lines) generated from 74 different individuals. Association analyses between T2D or its related traits and genetic risk score (GRS) calculated by combining genetic variants detected from GWAS for cellular NRF2 expression were performed using data from 8715 subjects. The T2D prediction model using GRS was evaluated by measuring the area under the curve (AUC) of the receiver operating characteristics (ROC) curve. Results Our GWAS identified six genetic variants (SNP) showing suggestive evidence of associations with cellular NRF2 expression (P < 10− 6). Logistic regression analysis demonstrated that GRS was associated with an increased risk of T2D (P value = 0.003, OR = 1.13). In addition, linear regression analyses showed positive associations between GRS and fasting glucose (P value = 0.028, β = 0.62), 2-h glucose (P value = 0.0004, β = 1.13) and HbA1C (P value = 0.033, β = 0.03). In the T2D prediction model using GRS, the AUC of the ROC curve was 0.69. Conclusion This study highlights genetic variants associated with cellular NRF2 expression and suggests that the GRS of NRF2 expression-associated variants is likely to be a useful indicator of T2D development in the human population.
#Genome-wide association study (GWAS) · Single nucleotide polymorphism (SNP) · Genetic risk score (GRS) · Type 2 diabetes (T2D) · Inflammation · Oxidative stress · Nuclear factor erythroid 2 like2 (NRF2)

목차

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Alberti KG / 1998 / Definition, diagnosis and classification of diabetes mellitus and its complications. Part 1 : diagnosis and classification of diabetes mellitus provisional report of a WHO consultation / Diabet Med 15:539~553 google schola Alfieri C / 1991 / Early events in Epstein-Barr virus infection of human B lymphocytes / Virology 181:595~608 google schola Asif M / 2014 / The prevention and control the type-2 diabetes by changing lifestyle and dietary pattern / J Educ Health Promot 3:1 google schola Barry JC / 2016 / Hyporesponsiveness to the antiinflammatory action of interleukin-10 in type 2 diabetes / Sci Rep 6:21244 google schola Chen L / 2011 / The worldwide epidemiology of type 2 diabetes mellitus–present and future perspectives / Nat Rev Endocrinol 8:228~236 google schola

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