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학술저널
저자정보
김진무 (고려대학교) 이승재 (고려대학교) 조은아 (고려대학교) 최은경 (고려대학교 생명공학과) 조민주 (고려대학교 생명공학과) 신소령 (전남대학교 수산생명의학과) 이정식 (전남대학교) 박현 (고려대학교)
저널정보
한국해양생명과학회 한국해양생명과학회지 한국해양생명과학회지 제6권 제2호
발행연도
2021.12
수록면
97 - 105 (9page)
DOI
10.23005/ksmls.2021.6.2.97

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꼬막은 해양 어업으로써 아시아 전 지역에 있어서 중요한 수산자원 중 하나이다. 하지만, 공장의 산업화, 해양 환경오염, 그리고 지구 온난화로 인해 해양 어업 생산량이 급격히 떨어졌다. 우리나라 남해안의 주요 수산자원인 꼬막의 유전적 특성을 파악하기 위하여 꼬막의 전장유전체를 해독하고 염색체 서열을 규명하였다. 915.4 Mb의 게놈을 조립하였고, 19개의 염색체 유전자 서열을 식별하였다. 꼬막의 유전체에서 25,134개의 유전자들을 확인하였고, 그 중에 22,745개의 유전자들에 대한 기능을 확인했으며, 4,014개의 유전자들에 대한 KEGG pathway를 분석하였다. 꼬막유전체와 8종의 다른 패류와 비교유전체 분석을 통하여 확장/감소(gene gain and loss) 분석을 수행한 결과, 725개의 유전자군의 확장과 479개의 유전자군의 감소를 확인하였다. 꼬막의 homeobox 유전자 클러스터는 촉수담륜동물 내에서 잘 보존된 유전자 구조를 보였다. 또한, 꼬막은 3개의 hemoglobin 유전자들이 피조개의 hemoglobin과 높은 유사성을 보였다. 꼬막의 전장유전체 정보를 통해 꼬막의 환경 적응과 진화의 유전적 특성과 생리적 특성뿐만 아니라, 꼬막 양식의 효율성을 높이는 양식산업에 널리 이용될 수 있는 유전적 정보를 제공할 것이다.
#꼬막 #유전자 확장/감소 분석 #호메오박스 #계통수 #헤모글로빈 #Tegillarca granosa #Gene gain-and-loss analysis #Homeobox #Phylogenetic tree #Hemoglobin

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Abbas Alkarkhi FM / 2008 / Assessment of arsenic and heavy metal contents in cockles(Anadara granosa)using multivariate statistical techniques / Journal of Hazardous Materials 150:783~789 google schola Bai CM / 2019 / Chromosomal-level assembly of the blood clam, Scapharca(Anadara)broughtonii, using long sequence reads and Hi-C / Gigascience 8 google schola Bao Y / 2011 / Hemoglobin of the bloody clam Tegillarca granosa(Tg-HbI)is involved in the immune response against bacterial infection / Fish & Shellfish Immunology 31:517~523 google schola Bao Z / 2002 / Automated de novo identification of repeat sequence families in sequenced genomes / Genome Res 12:1269~1276 google schola Barton HJ / 2019 / The Impact of Natural Selection on Short Insertion and Deletion Variation in the Great Tit Genome / Genome Biol Evol 11:1514~1524 google schola

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