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진채령 (공주대학교) 김인철 (전남대학교) 남형규 (국립생물자원관) 허위행 (국립생물자원관) 어수형 (공주대학교)
저널정보
한국조류학회 한국조류학회지 한국조류학회지 第27卷 第1號
발행연도
2020.6
수록면
50 - 55 (6page)
DOI
10.30980/KJO.2020.6.27.1.50

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흰목물떼새(Charadrius placidus)는 모래와 자갈이 있는 하천변에서 번식하는 드문 텃새로 국내에서는 멸종위기야생동물 II급으로 지정되어 보호받고 있다. 멸종위기야생동물의 연구를 위해서는 동물을 직접 포획하여 연구에 필요한 시료를 확보하는 것보다는 깃털, 분변 등과 같은 비침습적인 방법으로 시료를 확보하는 것이 제안되고 있다. DNA 바코딩 기법은 비침습적인 방법으로 확보한 시료로부터 종 동정을 가능하게 하므로 멸종위기종의 보전 및 관리에 도움을 준다. 조류 DNA 바코딩은 미토콘드리아 유전체의 COI(cytochrome C oxidase I) 염기서열 정보를 주로 이용하며, 많은 종에 적용 가능한 PCR 프라이머가 이미 개발되어 있다. 본 연구에서는 비침습적 시료를 이용하여 흰목물떼새를 근연종으로부터 동정할 목적으로 COI 바코딩을 수행하였다. 하지만 기존의 범용 조류 COI 바코딩 프라이머를 이용하여 흰목물떼새의 COI을 증폭하는 것이 어려웠으므로 이 영역을 증폭시킬 수 있는 새로운 프라이머를 개발하였다. 흰목물떼새 한 개체의 시료로부터 미토콘드리아 유전체 염기서열을 해독한 결과, 기존의 프라이머가 부착되는 흰목물떼새의 COI 염기서열 영역에 변이를 확인하였다. 이 변이가 해당 부분에 프라이머의 부착을 어렵게 하여 증폭을 방해한 것으로 보인다. 해독한 흰목물떼새의 미토콘드리아 유전체 염기서열을 참고하여 COI 영역을 증폭시킬 수 있는 새로운 프라이머를 개발하였고, 이 프라이머를 이용하여 흰목물떼새 13개체의 COI 영역을 증폭하고 염기서열을 해독하였다. 근연종인 꼬마물떼새(C. dubius), 왕눈물떼새(C. mongolus), 흰물떼새(C. alexandrinus)의 COI 영역과 흰목물떼새의 COI 염기서열을 비교한 결과, 흰목물떼새와 근연종 간의 염기서열이 명확하게 구분되었다. 본 연구에서 개발된 COI 영역의 프라이머는 흰목물떼새의 종 동정에 활용될 수 있을 것으로 생각한다.
#Charadrius placidus #DNA 바코딩 #비침습적 시료 #멸종위기야생동물 #미토콘드리아 유전체 #DNA barcoding #endangered species #non-invasive sample #mitochondrial genome

목차

요약
Abstract
서론
재료 및 방법
결과 및 고찰
References

참고문헌 (21)

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An J. / 2018 / Genetic study of endangered musk deer(Moschus moschiferus)using non-invasive genetic samples / Proc. Korean Soc. Environ. Ecol. Con 28:19 google schola Del Hoyo J. / 1996 / Handbook of the Birds of the World. Vol. 3 / Lynx Edicions :821 google schola Ferri E. / 2009 / Integrated taxonomy : traditional approach and DNA barcoding for the identification of filarioid worms and related parasites(Nematoda) / Frontiers in Zoology 6:1 google schola Han S. / 2018 / A New analysis method for molecular sex determination using non-invasive specimens in Long-tailed Goral / Proc. Korean Soc. Environ. Ecol. Con 28:82 google schola Hebert P. D. / 2003 / Biological identifications through DNA barcodes / Proc. R. Soc. Lond. B Biol. Sci. 270:313~321 google schola

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