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Whole genome sequence of Abeliophyllum distichum Nakai (Oleaceae) cultivar Ok Hwang 1 Ho, which is Korean endemic species, was recently sequenced to understand its characteristics. Acteoside is one of major useful compounds presenting various activities, and its several proposed biochemical pathways were reviewed and integrated to make precise biochemical pathway. Utilizing MetaPre-AITM which was developed for predicting secondary metabolites based on whole genome with the precise biochemical pathway of acteoside and the InfoBoss Pathway Database, we successfully rescued all enzymes involved in this pathway from the genome sequences, presenting that A. distichum cultivar Ok Hwang 1 Ho may produce acteoside. High-performance liquid chromatography result displayed that callus of A. distichum cultivar Ok Hwang 1 Ho contained acteoside as well as isoacteoside which may be derived from acteoside. Taken together, we successfully showed thatMetaPre-AITM can predict secondary metabolite from plant whole genomes. In addition, this method will be efficient to predict secondary metabolites of many plant species because DNA can be analyzed more stability than chemical compounds.
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D. K. Kim / 2011 / Molecular phylogeny of tribe Forsythieae(Oleaceae)based on nuclear ribosomal DNA internal transcribed spacers and plastid DNA trnL-F and matK gene sequences / Journal of plant research 124(3):339~347
Y. H. Ha / 2018 / Molecular phylogeny and dating of Forsythieae(Oleaceae)provide insight into the Miocene history of Eurasian temperate shrubs / Frontiers in plant science 9:99
Juhyeon Min / 2019 / The complete chloroplast genome of a new candidate cultivar, Sang Jae, of Abeliophyllum distichum Nakai (Oleaceae): initial step of A. distichum intraspecies variations atlas / Mitochondrial DNA Part B 4(2):3716~3718
Jongsun Park / 2019 / The complete chloroplast genome of Abeliophyllum distichum Nakai (Oleaceae), cultivar Ok Hwang 1ho: insights of cultivar specific variations of A. distichum / Mitochondrial DNA Part B 4(1):1640~1642
J. Park / 2019 / The complete chloroplast genome of a new candidate cultivar, Dae Ryun, of Abeliophyllum distichum Nakai(Oleaceae) / Mitochondrial DNA Part B 4(2):3713~3715
Y. H. Ha / 2018 / Molecular phylogeny and dating of Forsythieae(Oleaceae)provide insight into the Miocene history of Eurasian temperate shrubs / Frontiers in plant science 9:99
Juhyeon Min / 2019 / The complete chloroplast genome of a new candidate cultivar, Sang Jae, of Abeliophyllum distichum Nakai (Oleaceae): initial step of A. distichum intraspecies variations atlas / Mitochondrial DNA Part B 4(2):3716~3718
Jongsun Park / 2019 / The complete chloroplast genome of Abeliophyllum distichum Nakai (Oleaceae), cultivar Ok Hwang 1ho: insights of cultivar specific variations of A. distichum / Mitochondrial DNA Part B 4(1):1640~1642
J. Park / 2019 / The complete chloroplast genome of a new candidate cultivar, Dae Ryun, of Abeliophyllum distichum Nakai(Oleaceae) / Mitochondrial DNA Part B 4(2):3713~3715
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