Studies of Opsin Genes in a Smelt Fish, Ayu (Plecoglossus altivelis)

Minamoto, Toshifumi; Shimizu, Isamu

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자료유형: 학술저널

저자정보: Minamoto, Toshifumi (Center for Ecological Research, Kyoto University) Shimizu, Isamu (Center for Ecological Research, Kyoto University)

저널정보: 한국광과학회 Journal of photoscience : an international journal officail organ of the korean society of photoscience Journal of photoscience : an international journal officail organ of the korean society of photoscience 제9권 제2호

발행연도: 2002.1

수록면: 269 - 271 (3page)

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To investigate the visual and extra-ocular photoreception, we cloned the opsin genes in ayu (Plecoglossus allivelis). Amplified fragments encoding exon-4 (-5) of opsin cDNAs were cloned from the retina and brains of ayu, and sequenced. One clone was identified as rod (AYU-Rh), two as green cone (AYU-GI, -G2), one as red cone (A YU-R), two as ultraviolet cone (AYU-UVl, UV2), one as VA (AYU-VA), and one as extra-ocular rod (AYU-ExoRh) opsins. 335 amino acids sequence deduced from the full-length cDNA of AYU-Rh showed high identity with that of other fish. Southern blotting analysis indicated that ayu possess two 'rhodopsin' genes, one is visual rhodopsin and the other is non-visual extra-ocular rhodopsin. In situ hybridization showed that the mRNA of AYU-Rh was localized only in rod cells in the retina. On the other hands, AYU-ExoRh was expressed only in the pineal. We cloned two isoforms (AYU-VAM and -VAL) of VA opsin from ayu. The deduced amino acid sequences of these variants were identical to each other within the first 342 residues, but they showed divergence in the C-terminal sequence. AYU- VAL corresponded to the long isoform found in other fish, and AYU-VAM was identified as a new type of VA opsin variant. Pal-VAM is a new probably functional non-visual photoreceptive molecule in fish.

#Plecoglossus allivelis #rhodopsin #cone opsin #vertebrate ancient opsin

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이 논문의 저자 정보

Minamoto, Toshifumi

소속기관 Center for Ecological Research, Kyoto University

주요연구분야 자연과학 > 물리학

논문수 1 이용수 2

Shimizu, Isamu

소속기관 Division of Molecular Ecology, Center for Ecological Research, Kyoto University

주요연구분야 자연과학 > 물리학

논문수 2 이용수 2

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