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논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
이희은 (부산대학교) Sang-Je Park (Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology) 허재원 (한국생명공학연구원) Hiroo Imai (Kyoto University) 김희수 (부산대학교)
저널정보
한국분자세포생물학회 Molecules and Cells Molecules and Cells 제43권 제7호
발행연도
2020.1
수록면
607 - 618 (12page)

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microRNAs (miRNAs) are non-coding RNA molecules involved in the regulation of gene expression. miRNAs inhibit gene expression by binding to the 3′ untranslated region (UTR) of their target gene. miRNAs can originate from transposable elements (TEs), which comprise approximately half of the eukaryotic genome and one type of TE, called the long terminal repeat (LTR) is found in class of retrotransposons. Amongst the miRNAs derived from LTR, hsa-miR-3681 was chosen and analyzed using bioinformatics tools and experimental analysis. Studies on hsa-miR-3681 have been scarce and this study provides the relative expression analysis of hsa-miR-3681-5p from humans, chimpanzees, crab-eating monkeys, and mice. Luciferase assay for hsa-miR-3681-5p and its target gene SHISA7 supports our hypothesis that the number of miRNA binding sites affects target gene expression. Especially, the variable number tandem repeat (VNTR) and hsa-miR-3681-5p share the binding sites in the 3’ UTR of SHISA7, which leads the enhancer function of hsa-miR-3681-5p to inhibit the activity of VNTR. In conclusion, hsa-miR-3681-5p acts as a super-enhancer and the enhancer function of hsa-miR-3681-5p acts as a repressor of VNTR activity in the 3′ UTR of SHISA7.
#long terminal repeat #miR-3681-5p #SHISA7 #transposable elements #variable number tandem repeat

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참고문헌 (47)

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Agarwal, V. / 2015 / Predicting effective microRNA target sites in mammalian mRNAs / Elife 4:e05005 google schola Agren, J. A. / 2018 / Selfish genetic elements / PLoS Genet 14:e1007700 google schola Ambros, V. / 2003 / A uniform system for microRNA annotation / RNA 9:277~279 google schola Bartel, D. P / 2004 / MicroRNAs : genomics, biogenesis, mechanism, and function / Cell 116:281~297 google schola Bourque, G. / 2018 / Ten things you should know about transposable elements / Genome Biol 19:199 google schola

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