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저자정보
김인서 (서울대학교) 박지영 (서울대학교) 이윤선 (서울대학교) 이현오 (Phyzen Genomics Institute) Murukarthick Jayakodi (서울대학교) Nomar Espinosa Waminal (서울대학교) 강정화 (재단법인한택식물원) 이택주 (재단법인한택식물원) 성상현 (서울대학교) 박현승 (서울대학교) 김규엽 (식품의약품안전청) 양태진 (서울대학교)
저널정보
한국육종학회 Plant Breeding and Biotechnology Plant Breeding and Biotechnology Vol.5 No.4
발행연도
2017.1
수록면
334 - 343 (10page)

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Eclipta prostrata and E. alba are annual herbal medicinal plants and have been used as Chinese medicinal tonics. Both species are widely distributed in tropical and subtropical regions as well as in Korea. Both species have similar morphological features but E. alba has smoother leaf blade margins compared with E. prostrata. Although both species are utilized as oriental medicines, E. prostrata is more widely used than E. alba. Morphological semblances have confounded identification of either species. Here, we report the complete chloroplast genomes of both species to provide an authentication system between the two species and understand their diversity. Both chloroplast genomes were 151,733-151,757 bp long and composed of a large single copy (83,285-83,300 bp), a small single copy (18,283-18,346 bp), and a pair of inverted repeats (25,075-25,063 bp). Gene annotation revealed 80 protein coding genes, 30 tRNA genes and four rRNA genes. A phylogenetic analysis revealed that the genus Eclipta is grouped with Heliantheae tribe species in the Asteraceae family. A comparative analysis verified 29 InDels and 58 SNPs between chloroplast genomes of E. prostrata and E. alba. The low chloroplast genome sequence diversity indicates that both species are really close to each other and are not completely diverged yet. We developed six DNA markers that distinguish E. prostrata and E. alba based on the polymorphisms of chloroplast genomes between E. prostrata and E. alba. The chloroplast genome sequences and the molecular markers generated in this study will be useful for further research of Eclipta species and accurate classification of medicinal herbs.

목차

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참고문헌 (3)

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조호준 / 2017 / Authentication of Golden-Berry P. ginseng Cultivar ‘Gumpoong’ from a Landrace ‘Hwangsook’ Based on Pooling Method Using Chloroplast-Derived Markers / Plant Breeding and Biotechnology 5(1):16~24 dbpia 김인서 / 2017 / The Complete Chloroplast Genome Sequence and Intra-Species Diversity of Rhus chinensis / Plant Breeding and Biotechnology 5(3):243~251 dbpia 김규헌 / 2015 / 유전자 마커를 이용한 하수오, 백수오 및 이엽우피소 종 판별법 개발 / 한국식품위생안전성학회지 30(3):289~294 dbpia

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