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논문 기본 정보

자료유형
학술저널
저자정보
Yanwei Feng (Shandong Marine Resource and Environment Research Institute) Qi Li (Ocean University of China) Hong Yu (Ocean University of China) Lingfeng Kong (Ocean University of China)
저널정보
한국유전학회 Genes & Genomics Genes & Genomics Vol.39 No.8
발행연도
2017.1
수록면
867 - 875 (9page)

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The complete mitochondrial genome of Cucullaea labiata (Arcoida: Cucullaeidae) was firstly determined in this study in order to better understand the phylogenetic relationship between Cucullaeidae and Arcidae. The C. labiata mitochondrial genome was 25,845 bp in size and contained 12 protein-coding genes, 2 rRNA and 22 tRNA genes. The number and the location of the tRNA genes were different from three Arcidae species (Scapharca broughtonii, Scapharca kagoshimensis and Tegillarca granosa). Gene arrangement also differed dramatically. The length of the non-coding regions was 10,559 bp, in which the largest one (6057 bp) included eight point nine copies of a 659 bp repeat motif. The number of repeated sequences was different in different individuals, similar to the findings from the mitochondrial genome of S. broughtonii and Placopecten magellanicus. One intron was found in cox1 gene both in CL_98 and in CL_99 individuals of C. labiata. The reason why mitochondrial introns are retained so scarcely in bivalve taxa needs further research. Phylogenetic analyses based on 12 concatenated amino acid sequences of protein-coding genes supported Cucullaeidae was the sister group of Arcidae.

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Abascal F / 2005 / ProtTest: selection of bestfit models of protein evolution / Bioinformatics 21:2104~2105 google schola Benson G / 1999 / Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences / Nucleic Acids Res 27:573~580 google schola Boore JL / 1999 / Animal mitochondrial genomes / Nucleic Acids Res 27:1767~1780 google schola Boore JL / 2000 / Mitochondrial genomes of Galathealinum, Helobdella, and Platynereis: sequence and gene arrangement comparisons indicate that Pogonophora is not a phylum and Annelida and Arthropoda are not sister taxa / Mol Biol Evol 17:87~106 google schola Boss KJ / 1982 / Synopsis and classification of living organisms, vol 1 / McGraw-Hill :1111 google schola

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