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저자정보
Yousri Abdelmutalab Abdelhafiz (University of Malaya) Yousri Abdelmutalab Abdelhafiz (University of Malaya) Thamilvaani Manaharan (University of Malaya) Saharuddin Bin Mohamad (University of Malaya)
저널정보
한국유전학회 Genes & Genomics Genes & Genomics Vol.39 No.8
발행연도
2017.1
수록면
877 - 886 (10page)

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The genus Bacillus is a Gram-positive, aerobic, endospore-forming, rod-shaped bacterium commonly found in the environment that have important industrial, medical, agriculture and environmental values. Here, we report the whole genome sequence analysis of UMX-103 which was isolated from a hydrocarbon contaminated site in Terengganu, Malaysia. An integration of both genomics and chemical approaches were conducted to analyse the biosurfactant production by the strain UMX-103. The genome was assembled using a combination of both de novo and reference-guided assembly methods. The genome size of UMX-103 is 4,234,627 bp with 4399 genes comprising of 4301 protein-coding genes and 98 RNA genes. The mapping results showed 93.44% of genome similarity with B. subtilis strain 168. We have identified 25 genes involved in biosurfactants production. Among the 25 identified genes, 14 genes were involved in surfactin biosynthesis and 11 genes were implicated in surfactin regulation. Fifteen genomic islands were identified which are different from other closely related Bacillus species. In addition, our study also revealed the genetic contents of this bacterium and genes which are involved in biosurfactant production.

목차

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Alvarez VM / 2015 / Bacillus amyloliquefaciens TSBSO 3.8, a biosurfactant-producing strain with biotechnological potential for microbial enhanced oil recovery / Colloids Surf B 136:14~21 google schola Banat IM / 1993 / The isolation of a thermophilic biosurfactant producing Bacillus sp / Biotechnol Lett 15:591~594 google schola Banat IM / 2000 / Potential commercial applications of microbial surfactants / Appl Microbiol Biotechnol 53:495~508 google schola Bernheimer A / 1970 / Nature and properties of a cytolytic agent produced by Bacillus subtilis / Microbiology 61:361~369 google schola Bodour AA / 2003 / Distribution of biosurfactant-producing bacteria in undisturbed and contaminated arid southwestern soils / Appl Environ Microbiol 69:3280~3287 google schola

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