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한국 전통 음식으로 알려진 김치의 발효는 다양한 미생물에 의해 일어나며, 주로 Leuconostoc 속, Weissella 속, Lactobacillus 속 유산균들이 관여한다. 또한 김치의 미생물 군집은 김치의 종류, 발효 조건, 재료 및 성분 등에 따라 분포와 차이가 다르게 나타난다. 본 연구는 중부지방(강원도, 경기도)과 남부지방(전라도, 경상도) 김치에 대한 미생물 군집을 분석하기 위해 16S rRNA 유전자를 증폭하여 차세대 염기서열분석법을 실시하였다. 모든 시료가 99% 이상의 Good’s coverage of library를 보여 비교분석을 하는데 충분한 신뢰성을 얻었으며, α-diversity 분석에서 종 풍부도와 다양성은 시료 간 유의미한 차이가 나타나지 않았다. 중부지방과 남부지방 김치에 공통적으로 분포하고 있는 주요 세균 문은 Frimicutes 이었으며, 속 수준에서 Weissella kandleri 가 각 46.5%(중부지방), 30.8%(남부지방)로 가장 우점하였다. 마지막으로 중부지방과 남부지방의 미생물 군집을 대표하는 바이오마커를 확인하기 위해 LEfSe 분석을 실시한 결과, 중부지방에서 Leuconostocaceae (71.4%) 과, 남부지방에서 Lactobacillaceae (61.0%) 과가 통계적으로 유의미한 빈도 차이를 보였다. 따라서, 본 연구는 중부지방과 남부지방에서 나타나는 김치 미생물 군집의 분포와 차이를 규명하였으며, 이를 바탕으로 지역별 유사점과 차이점에 대한 미생물 군집의 분포를 연구하기 위한 과학적 기초자료를 제공할 것으로 예상된다.
목차
서론
재료 및 방법
결과 및 고찰
References
초록
참고문헌 (30)
참고문헌 신청
Cao, Y., Fanning, S., Proos, S., Jordan, K. and Srikumar, S. 2017. A review on the applications of next generation sequencing technologies as applied to food-related microbiome Studies. Front. Microbiol. 8, 1829.
Cha, Y. J., Lee, Y. M., Jung, Y. J., Jeong, E. J., Kim, S. J., Park, S. Y., Yoon, S. S. and Kim, E. J. 2003. A nationwide survey on the preference characteristics of minor ingredients for winter kimchi. J. Kor. Soc. Food Sci. Nutr. 32, 555-561.
Chen, J., Bittinger, K., Charlson, E. S., Hoffmann, C., James, L., Wu, G. D., Collman, R. G. and Bushman, F. D., Li, H. 2012. Associating microbiome composition with environmental covariates using generalized UniFrac distances. Bioinformatics 28, 2106-211
Dharaneedharan, S. and Heo, M. S. 2016. Korean traditional fermented foods - A potential resource of beneficial microorganisms and their applications. J. Life Sci. 26, 496-502.
Garofalo, C., Bancalari, E., Milanovic, V., Cardinali, F., Osimani, A., Sardaro, M. L. S., Bottari, B., Bernini, V. Aquilanti, L., Clementi, F., Neviani, E. and Gatti, M. 2017. Study of the bacterial diversity of foods: PCR-DGGE versus LH-PCR. Int. J. Foo
Cha, Y. J., Lee, Y. M., Jung, Y. J., Jeong, E. J., Kim, S. J., Park, S. Y., Yoon, S. S. and Kim, E. J. 2003. A nationwide survey on the preference characteristics of minor ingredients for winter kimchi. J. Kor. Soc. Food Sci. Nutr. 32, 555-561.
Chen, J., Bittinger, K., Charlson, E. S., Hoffmann, C., James, L., Wu, G. D., Collman, R. G. and Bushman, F. D., Li, H. 2012. Associating microbiome composition with environmental covariates using generalized UniFrac distances. Bioinformatics 28, 2106-211
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