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학술저널
저자정보
Ali Dalir Ghaffari (Tarbiat Modares University) Abdolhossein Dalimi (Tarbiat Modares University) Fatemeh Ghaffarifar (Tarbiat Modares University) Majid Pirestani (Tarbiat Modares University)
저널정보
대한백신학회 Clinical and Experimental Vaccine Research Clinical and Experimental Vaccine Research Vol.9 No.2
발행연도
2020.1
수록면
81 - 96 (16page)

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Purpose: Toxoplasma gondii is an opportunistic parasite infecting all warm-blooded animals including humans. The dense granule antigens (GRAs) play an important role in parasite survival and virulence and in forming the parasitophorous vacuole. Identification of protein characteristics increases our knowledge about them and leads to develop the vaccine and diagnostic studies. Materials and Methods: This paper gave a comprehensive definition of the important aspects of GRA12 protein, including physico-chemical features, a transmembrane domain, subcellular position, secondary and tertiary structure, potential epitopes of B-cells and T-cells, and other important features of this protein using different and reliable bioinformatics methods to determine potential epitopes for designing of a high-efficient vaccine. Results: The findings showed that GRA12 protein had 53 potential post-translational modification sites. Also, only one transmembrane domain was recognized for this protein. The secondary structure of GRA12 protein comprises 35.55% alpha-helix, 19.50% extended strand, and 44.95% random coil. Moreover, several potential B- and T-cell epitopes were identified for GRA12. Based on the results of the Ramachandran plot, 79.26% of amino acid residues were located in favored, 11.85% in allowed and 8.89% in outlier regions. Furthermore, the results of the antigenicity and allergenicity assessment noted that GRA12 is immunogenic and non-allergenic. Conclusion: This research provided important basic and conceptual data on GRA12 to develop an effective vaccine against acute and chronic toxoplasmosis for further in vivo investigations. More studies are required on vaccine development using the GRA12 alone or combined with other antigens in the future.
#Toxoplasma gondii #Epitope mapping #Computational biology #Vaccines

목차

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참고문헌 (40)

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Shaddel M / 2014 / The prevalence of toxoplasmosis in Imam Reza Hospital blood bank samples, Tehran, Iran / Transfus Apher Sci 51:181~183 google schola Ghaffari AD / 2019 / Molecular identification of Toxoplasma gondii in the native slaughtered cattle of Tehran province, Iran / J Food Qual Hazards Control 6:153~161 google schola Foroutan M / 2018 / Bioinformatics analysis of ROP8 protein to improve vaccine design against Toxoplasma gondii / Infect Genet Evol 62:193~204 google schola Chaichan P / 2017 / Geographical distribution of Toxoplasma gondii genotypes in Asia : a link with neighboring continents / Infect Genet Evol 53:227~238 google schola Sibley LD / 2009 / Genetic diversity of Toxoplasma gondii in animals and humans / Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci 364:2749~2761 google schola

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